全能神已被韩国基督教组织认定为邪教

2002年该教会进入韩国华人基督教会进行非法传教活动，严重的干扰了韩国基督教正常的宗教活动。援引韩国《国民日报》2013年11月2日报道，2013年10月30日至31日，韩国基督教监理会在首尔江南区光临教会召开了第31次大会，会议主题为“今天的革新、明天的希望”，大会决定将“全能神教会”等9个团体划定为异端。2014年9月15日，“韩国教会言论会”发文指出全神能是不折不扣的异端组织，呼吁媒体不要为了经济利益为其“撑腰”。

2016年2月17日韩国基督教总联合会下属异端对策委员会发布声明认定全能神教会为异端并要求韩国国民防范来自中国异端全能神教会，韩国国内各教团提高警惕，防范威胁韩国教会的最新邪教的行动。